こんにちは
送料無料であれば、オーダーディスカウントでいけると思います。
いくつかの商品を指定しておいてこれらの中から2個買うと何ドル引き、または何％引きみたいにできるので。

1.購入後の部分返金

支払いの確認後に＄〇〇を返金すると伝える。
Purchase shipping labelのプルダウンにSend refundがあるので、約束した金額を入力して返金する。
以前は部分返金についてFVFが返金されなかったが、現在はFVFが返金されるので問題はない。
2商品購入された場合、ディスカウント相当の返金額は商品ごとに分ける。
例えば＄100+＄100で＄200、ディスカウント10％なら、それぞれの商品ごとに＄10を返金する。
1商品から＄20を引いた場合、＄100の商品を返品されると1商品を＄80で販売したことになってします。

2.セットにして新規で出品

この場合、新規で出品した後、必ずURLを送って購入を促す。
その商品だけリターンを拒否したり、フリーリターンにするなど自分を有利にすることもできる。

3.Promotionsを使う

Manage promotionsのOrder Discountで設定する。
慣れていないならお勧めしない。

こんな感じですね。
他にはクーポンを送ることも可能です。

1kimagureonnaさん、おはようございます。

2つセットの商品ページを作り直す

おすすめ。

バイヤーが購入前にメッセージでディスカウント額を伝えて、購入後に一部返金したりしています。
バイヤーが先にお金を多く支払うのを渋るようでしたらオファーを送ってもらうとかになります。
ebayの設定ではボリュームディスカウントは同一商品にしか適用されません。
送料を設定していれば２つ目以降から送料を安くする設定はできるので、それは違うリストの商品にも適用されたと思います。
1kimagureonnaさんが考えているようなセット販売での割引設定はなかったと思います。