ペイオニアにPayoutしても有利に働くという要素は全くないと思われます。
場合によっては悪い方向へ進んでしまうかもしれません。

現時点で未着ケースやリターンリクエストがなく資金がホールドもされていないとします。
バイヤーが出来ることは下記になります。

1.未着でのケースオープン
2.リターンリクエスト
3.Payment Dispute

1と2はバイヤーの関税拒否が証明できればebayの売手保護で守られることにはなっています。
しかし、3については決済会社が判断をすることになっています。
商品が日本に戻るのであれば、実際にバイヤーは商品を受け取っていませんので決済会社が返金をする確率のほうが高いです。
この場合、ebayはセラーの資金から強制的に返金を行うことになります。
おそらく売手保護も適用されません。

強制返金時にAvailableの資金は問題になりません。
また、Availableにこの取引の資金があるかも問題にはなりません。
該当の取引の資金がPayoutされていたとしても、他の取引の資金がAvailableにあればそこから差し引かれます。
Availableに資金がない、もしくは不足している場合にはAvailableの残高がマイナスになります。
このマイナスが解消されなければ登録したクレジットカードに請求が行われます。
その時のレートが適用されて為替交換手数料を支払う形になるので、割高な支払いとなってしまいます。
そして、仮にクレジットカードでも決済が出来ない場合、一定期間内にマイナスを解消できなければアカウントが制限されてしまいます。
そのため、今回のようなケースにおいてはDailyに変更するのではなく、Montly を維持して支払いに備える必要があります。

さらに、1と2でセラー保護が適用されたとしても、バイヤーはその後にPayment Disputeを申請することが可能です。
Payment Disputeで負けた場合は処理費用も請求されます。
少し記憶があいまいですがFVFも返金されなかったような気がします。
そのため、このケースではPayment Disputeに進んでしまうと、予想よりも大きな損失を受ける可能性があります。

次にバイヤーと平和的に話し合い、送料・返送料を差し引いての返金に合意できたとします。
例えば商品代金が＄1000でFVFが18％（＄180）だったとしましょう。
発送時の送料として＄30、返送料として＄50の合計＄80を差し引いた＄920を返金することになります。
しかし、この場合は部分返金となるためFVFの＄180は戻ってきません。
そのため、差し引きでは＄100の損失が発生することになります。
損失を防ぐためには＄260を差し引く必要があります。
ただし、関税の支払いを拒否しているバイヤーですので、合意できる可能性は低くなります。

ebayの相談をした場合、送料、返送料、その他の経費を差し引いた金額を返金しても良いとの回答があるでしょう。
セラーとしては＄260を差し引いた金額の返金を考えると思います。
ebayのポリシー上ではそれで問題がありません。
ただし、決済会社の取り扱いは別の話です。
この差し引いた＄260に対してPayment Disputeを申請することが可能です。
申請が行われた場合、決済会社は高確率で返金を行います。
ebayでは強制返金が行われ、処理手数料も請求されると思われます。
Payment Disputeでの返金なのでディフェクトはカウントされませんが、損失は大きくなります。

今のうちにバイヤーと返金の取り扱いについてしっかりと話し合ったほうがいいですよ。

以前私がDailyに変更した際には、変更の反映は数日以内もしくは翌営業日だったかと記憶しています。

・payoutタイミングを montly にするメリットは率直に何でしょうか。
ebayからペイオニアに出勤する際、手数料がかからないと認識しているのですが、
その場合、dailyのpayout設定を選ぶデメリットがない気がするのですが・・

確かにその通りですね。ただ法人の場合には、月分をまとめて財務部が対応したいのでその方が都合が良い場合もあるようですね。

補足です
：ebayからpayoutしたい資金は10日ほど前に既に Available です

また別に関連する質問です

・payoutタイミングを montly にするメリットは率直に何でしょうか。

ebayからペイオニアに出勤する際、手数料がかからないと認識しているのですが、
その場合、dailyのpayout設定を選ぶデメリットがない気がするのですが・・

どうぞよろしく御願いいたします。