仕入れ先から直送でしたらありえない行為だと思います。

Cainiao Super Economy Global は主にAliExpressで利用されている発送方法だと思うのですが、AliExpressで購入した商品を直接的にバイヤーの住所に発送している場合、ebayのポリシー違反となりアカウントがサスペンドされる可能性があります。
この部分においてバイヤーの評価は関係がありません。
Amazon等で購入した商品を同様に発送した場合もポリシー違反となります。
AmazonのFBAからのebayのバイヤーへの発送もポリシー違反、厳密にはAmazonの箱を使って発送することもポリシー違反となります。

どのような発送方法を利用、ebay上で選択していたとしても、ebayのシステムでスキャンできない場合、Uploaded on time but no carrier scanは悪化します。
Late shipment rateはバイヤーのフィードバック時の申告でカバーされる部分もありますが、Tracking uploadedはebayとのシステム連携との関係性なので悪化は避けられないと考えられます。

日本eBayに経過を連絡して、メッセージやりとりで到着していることが分かれば
アカウントに影響しませんとか回答が帰ってきます。

追跡番号入力の後に配送業者を........?????
間違いなく商品は発送されて到着しています。

投稿内容がよくわかりません、質問です。
①追跡番号は何処から引っ張ってきましたか？

②Courierは何処を使われましたか？