Managed Paymentsの前後で違います。
資金の受け取りがPaypalの場合、Paypalに資金がなければ手動での返金は出来ません。
ebayでクレームからの強制返金、もしくはPaypalで異議からの強制返金は可能だと思います。
この場合、Paypal残高がマイナスとなり、120日以内(だったと思います)にマイナスを解消しないとPaypalがサスペンドされます。
資金の受け取りがManaged Paymentsの後であればAvailable fundsに返金に必要な資金が入ってから返金を行います。
もしくはバイヤーにケースをオープンしてもらいます。
ケースに対応する形であればAvailable fundsに資金がなくとも返金が可能で、その場合はAvailable fundsにマイナスが記録されます。
このマイナスが一定の期間、解消されない場合は登録クレジットカードで決済されます。
Payout settingsで払い出しがdailyの場合、Available fundsがマイナスになりやすいです。
特にUS時間で非営業日は処理が行われないので注意が必要です。